En febrero de 1984, un activo colaborador de Hábitat Internacional vino a Nicaragua en una gira de trabajo con CEPAD, una organización nicaragüense cristiana para el desarrollo de la comunidad. En esa ocasión se entrevisto con el Presidente y fundador de CEPAD y aprovechó la oportunidad para hablarle de Hábitat para la Humanidad. Es así que CEPAD invitó a HPH a trabajar en Nicaragua.

Meses más tarde HPHI envió a dos representantes para hacer una evaluación de las posibilidades de trabajar en Nicaragua. Los cuales recomendaron trabajar aquí y fue así que en octubre de ese mismo año, HPHI envío a una colaboradora internacional para iniciar los trabajos oraganizativos en la comunidad de "Germán Pomares" en Chinandega.

En ese tiempo por la guerra en Nicaragua, HPH decidió trabajar bajo la cobertura legal de CEPAD que era una organización muy conocida y confiable por sus principios cristianos. En 1986 se inicio la construcción de las primeras 16 viviendas.

En 1991, HPHI inicio un proceso de nacionalización de los programas de Hábitat en el área de América Latina y el caribe. En ese proceso, se invitaron a 5 personas nicaragüenses a fundar la Asociación y logró constituirse legalmente. En marzo de 1995, la Asamblea Nacional de Nicaragua le aprobó sus Estatutos.

Actualmente el número de afiliados aprobados por HPHI son 6 "Germán Pomares", Jinotega, Esquipulas Bluefields, Mulukukú y El Crucero. De éstos únicamente Jinotega y Bluefields están funcionando. En mayo de 1998, HPHI aprobó como afiliados en proceso de formación a Diriamba y Matagalpa.

Hasta mayo de 1998, HPHI ha facilitado la construcción de 1,500 viviendas proveyendo de una vivienda digna, económica y sencilla a 7,500 personas aproximadamente.