โครงสร้างบริหาร
ฝ่ายบริหารงานทั่วไป
กลุ่มงานระบาดวิทยา
กลุ่มงานกีฏวิทยา
กลุ่มงานสนับสนุนปฏิบัติการ
กลุ่มงานชัณสูตร
กลุ่มงานมาตรฐานการรักษา
กลุ่มงานพัฒนาพฤติกรรมสุขภาพ
ศูนย์ควบคุมโรคติดต่อนำโดยแมลงที่ 21 แม่ฮ่องสอน
ศูนย์ควบคุมโรคติดต่อนำโดยแมลงที่ 22 ลำปาง
ศูนย์ควบคุมโรคติดต่อนำโดยแมลงที่ 23 แพร่
ศูนย์ควบคุมโรคติดต่อนำโดยแมลงที่ 24 พิษณุโลก
ศูนย์ควบคุมโรคติดต่อนำโดยแมลงที่ 25 เพชรบูรณ์
ศูนย์ควบคุมโรคติดต่อนำโดยแมลงที่ 26 เชียงราย
ศูนย์ควบคุมโรคติดต่อนำโดยแมลงที่ 27 เชียงใหม่